Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNI2P48788 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms