Protein–RNA interactions for Protein: P48566

MSB3, GTPase-activating protein GYP3, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSB3	P48566	YER076W-A	YER076W-A	348 nt		5	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	TDA5	YLR426W	981 nt		5	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	YBL083C	YBL083C	426 nt		5	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	PRP39	YML046W	1890 nt		5	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	MDM36	YPR083W	1740 nt		5	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	VPS73	YGL104C	1461 nt		5	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	ARX1	YDR101C	1782 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	CSN9	YDR179C	489 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	YEL045C	YEL045C	426 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	HMF1	YER057C	390 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	RPL30	YGL030W	318 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	YIL012W	YIL012W	342 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	YOR385W	YOR385W	873 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	RPG1	YBR079C	2895 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	PHO90	YJL198W	2646 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	IMA1	YGR287C	1770 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	HCS1	YKL017C	2052 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	YBR225W	YBR225W	2703 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	OPI6	YDL096C	327 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	YPL229W	YPL229W	621 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	PCK1	YKR097W	1650 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	YOR022C	YOR022C	2148 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	NIC96	YFR002W	2520 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	RPC11	YDR045C	333 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	YHR139C-A	YHR139C-A	312 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	YOR302W	YOR302W	78 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	BUD14	YAR014C	2130 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	HRK1	YOR267C	2280 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MSB3	P48566	YFH1	YDL120W	525 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	RPL34A	YER056C-A	366 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	YHL026C	YHL026C	948 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	YHR193C-A	YHR193C-A	375 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	RPL34B	YIL052C	366 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	RPL40A	YIL148W	387 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	ASC1	YMR116C	960 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	YPL142C	YPL142C	318 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	PRM7	YDL039C	2097 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	SLK19	YOR195W	2466 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	YCR045W-A	YCR045W-A	351 nt		4.95	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	MFA1	YDR461W	111 nt		4.95	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	YEL020C-B	YEL020C-B	198 nt		4.95	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	GPI14	YJR013W	1212 nt		4.95	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	YLR076C	YLR076C	423 nt		4.95	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	MNN1	YER001W	2289 nt		4.95	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	DBF20	YPR111W	1695 nt		4.95	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	SAC1	YKL212W	1872 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	PDR12	YPL058C	4536 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	PRP28	YDR243C	1767 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	YLL032C	YLL032C	2478 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	YAR070C	YAR070C	300 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	URA10	YMR271C	684 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	ROG3	YFR022W	2202 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	CTT1	YGR088W	1689 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	YFR054C	YFR054C	579 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	YAL059C-A	YAL059C-A	423 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	RPL15A	YLR029C	615 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	IRC23	YOR044W	474 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	DIB1	YPR082C	432 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	SUM1	YDR310C	3189 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	DAL81	YIR023W	2913 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	ARN2	YHL047C	1863 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	DSL1	YNL258C	2265 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	YCR050C	YCR050C	309 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	ALG13	YGL047W	609 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	COX19	YLL018C-A	297 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	SCY1	YGL083W	2415 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	IMD4	YML056C	1575 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	TIF35	YDR429C	825 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	IRC4	YDR540C	540 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	RPL26A	YLR344W	384 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	SRL1	YOR247W	633 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	YER077C	YER077C	2067 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	VPS45	YGL095C	1734 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	APP1	YNL094W	1764 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	CYM1	YDR430C	2970 nt		4.9	□□□□□ -1.62
MSB3	P48566	YDL062W	YDL062W	426 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	HSK3	YKL138C-A	210 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	ISA1	YLL027W	753 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	snR13	snR13	124 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	DSF2	YBR007C	2211 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	ESF1	YDR365C	1887 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	GSM1	YJL103C	1857 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	MNT4	YNR059W	1743 nt		4.89	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	MVP1	YMR004W	1536 nt		4.89	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	YDR526C	YDR526C	471 nt		4.89	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	TMA10	YLR327C	261 nt		4.89	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	YMR141W-A	YMR141W-A	225 nt		4.89	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	IST1	YNL265C	897 nt		4.89	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	YBR064W	YBR064W	429 nt		4.89	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	RPC40	YPR110C	1008 nt		4.89	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	CLF1	YLR117C	2064 nt		4.88	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	NPR2	YEL062W	1848 nt		4.88	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	YND1	YER005W	1893 nt		4.88	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	MIC19	YFR011C	513 nt		4.88	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	ATX1	YNL259C	222 nt		4.88	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	CTM1	YHR109W	1758 nt		4.88	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	SAP155	YFR040W	3009 nt		4.88	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	ASI1	YMR119W	1875 nt		4.88	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	TCB3	YML072C	4638 nt		4.87	□□□□□ -1.63
MSB3	P48566	PXA1	YPL147W	2613 nt		4.87	□□□□□ -1.63

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