Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms