Protein–RNA interactions for Protein: P32829

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, yeastyeast

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MRE11P32829 AI2Q0055 2565 nt2.92□□□□□ -1.94
MRE11P32829 TMA20YER007C-A 546 nt2.92□□□□□ -1.94
MRE11P32829 SRP21YKL122C 504 nt2.92□□□□□ -1.94
MRE11P32829 DAD2YKR083C 402 nt2.92□□□□□ -1.94
MRE11P32829 CWC24YLR323C 780 nt2.92□□□□□ -1.94
MRE11P32829 VMA6YLR447C 1038 nt2.92□□□□□ -1.94
MRE11P32829 MIX23YBL107C 591 nt2.92□□□□□ -1.94
MRE11P32829 CSM4YPL200W 471 nt2.92□□□□□ -1.94
MRE11P32829 UTP14YML093W 2700 nt2.92□□□□□ -1.94
MRE11P32829 CWC22YGR278W 1734 nt2.92□□□□□ -1.94
MRE11P32829 MED1YPR070W 1701 nt2.92□□□□□ -1.94
MRE11P32829 KIN82YCR091W 2163 nt2.92□□□□□ -1.94
MRE11P32829 GYP7YDL234C 2241 nt2.92□□□□□ -1.94
MRE11P32829 YLR446WYLR446W 1302 nt2.92□□□□□ -1.94
MRE11P32829 FMP32YFL046W 624 nt2.91□□□□□ -1.94
MRE11P32829 YHR213WYHR213W 597 nt2.91□□□□□ -1.94
MRE11P32829 CKA1YIL035C 1119 nt2.91□□□□□ -1.94
MRE11P32829 YJR087WYJR087W 351 nt2.91□□□□□ -1.94
MRE11P32829 TDA8YAL064C-A 381 nt2.91□□□□□ -1.94
MRE11P32829 YAR062WYAR062W 597 nt2.91□□□□□ -1.94
MRE11P32829 IRC21YMR073C 606 nt2.91□□□□□ -1.94
MRE11P32829 RPL33AYPL143W 324 nt2.91□□□□□ -1.94
MRE11P32829 UTP15YMR093W 1542 nt2.91□□□□□ -1.94
MRE11P32829 TFB1YDR311W 1929 nt2.91□□□□□ -1.94
MRE11P32829 DSF2YBR007C 2211 nt2.91□□□□□ -1.94
MRE11P32829 YCK2YNL154C 1641 nt2.9□□□□□ -1.94
MRE11P32829 MFB1YDR219C 1398 nt2.9□□□□□ -1.94
MRE11P32829 VHR2YER064C 1518 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 KAR9YPL269W 1935 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 snR9snR9 187 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 YDR018CYDR018C 1191 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 YGR053CYGR053C 852 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 YKR033CYKR033C 426 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 RRT16YNL105W 429 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 YAP7YOL028C 738 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 SCY1YGL083W 2415 nt2.9□□□□□ -1.95
MRE11P32829 BOI1YBL085W 2943 nt2.89□□□□□ -1.95
MRE11P32829 ILS1YBL076C 3219 nt2.89□□□□□ -1.95
MRE11P32829 FAA2YER015W 2235 nt2.89□□□□□ -1.95
MRE11P32829 IKI3YLR384C 4050 nt2.89□□□□□ -1.95
MRE11P32829 RPN3YER021W 1572 nt2.89□□□□□ -1.95
MRE11P32829 AST2YER101C 1293 nt2.89□□□□□ -1.95
MRE11P32829 FAR7YFR008W 666 nt2.89□□□□□ -1.95
MRE11P32829 PNC1YGL037C 651 nt2.89□□□□□ -1.95
MRE11P32829 YIL012WYIL012W 342 nt2.89□□□□□ -1.95
MRE11P32829 YJL119CYJL119C 324 nt2.89□□□□□ -1.95
MRE11P32829 SFT1YKL006C-A 294 nt2.89□□□□□ -1.95
MRE11P32829 TPK2YPL203W 1143 nt2.89□□□□□ -1.95
MRE11P32829 YPR050CYPR050C 414 nt2.89□□□□□ -1.95
MRE11P32829 PIS1YPR113W 663 nt2.89□□□□□ -1.95
MRE11P32829 NMA111YNL123W 2994 nt2.89□□□□□ -1.95
MRE11P32829 YEL1YBL060W 2064 nt2.89□□□□□ -1.95
MRE11P32829 VHR1YIL056W 1923 nt2.89□□□□□ -1.95
MRE11P32829 ICR1ICR1 3199 nt2.89□□□□□ -1.95
MRE11P32829 SAP1YER047C 2694 nt2.88□□□□□ -1.95
MRE11P32829 YCR090CYCR090C 549 nt2.88□□□□□ -1.95
MRE11P32829 OCA6YDR067C 675 nt2.88□□□□□ -1.95
MRE11P32829 YDR115WYDR115W 318 nt2.88□□□□□ -1.95
MRE11P32829 VMA21YGR105W 234 nt2.88□□□□□ -1.95
MRE11P32829 RSR1YGR152C 819 nt2.88□□□□□ -1.95
MRE11P32829 YIL174WYIL174W 228 nt2.88□□□□□ -1.95
MRE11P32829 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.88□□□□□ -1.95
MRE11P32829 YKL222CYKL222C 2118 nt2.88□□□□□ -1.95
MRE11P32829 GMC2YLR445W 567 nt2.88□□□□□ -1.95
MRE11P32829 CSI1YMR025W 888 nt2.88□□□□□ -1.95
MRE11P32829 AIM36YMR157C 768 nt2.88□□□□□ -1.95
MRE11P32829 HEM4YOR278W 828 nt2.88□□□□□ -1.95
MRE11P32829 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.88□□□□□ -1.95
MRE11P32829 NFT1YKR103W 3657 nt2.88□□□□□ -1.95
MRE11P32829 SSP1YHR184W 1716 nt2.88□□□□□ -1.95
MRE11P32829 AIM26YKL037W 357 nt2.87□□□□□ -1.95
MRE11P32829 COX8YLR395C 237 nt2.87□□□□□ -1.95
MRE11P32829 YNL150WYNL150W 408 nt2.87□□□□□ -1.95
MRE11P32829 ATG3YNR007C 933 nt2.87□□□□□ -1.95
MRE11P32829 NCS2YNL119W 1482 nt2.87□□□□□ -1.95
MRE11P32829 ALY1YKR021W 2748 nt2.87□□□□□ -1.95
MRE11P32829 TLC1TLC1 1301 nt2.87□□□□□ -1.95
MRE11P32829 ROG1YGL144C 2058 nt2.86□□□□□ -1.95
MRE11P32829 SRB8YCR081W 4284 nt2.86□□□□□ -1.95
MRE11P32829 NCB2YDR397C 441 nt2.86□□□□□ -1.95
MRE11P32829 COG2YGR120C 789 nt2.86□□□□□ -1.95
MRE11P32829 MTM1YGR257C 1101 nt2.86□□□□□ -1.95
MRE11P32829 TCD1YHR003C 1290 nt2.86□□□□□ -1.95
MRE11P32829 SDL1YIL167W 633 nt2.86□□□□□ -1.95
MRE11P32829 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.86□□□□□ -1.95
MRE11P32829 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.86□□□□□ -1.95
MRE11P32829 PDP3YLR455W 915 nt2.86□□□□□ -1.95
MRE11P32829 SMA2YML066C 1110 nt2.86□□□□□ -1.95
MRE11P32829 ATP18YML081C-A 180 nt2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.3 ms