Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTX2P32243 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTX2P32243 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTX2P32243 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTX2P32243 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTX2P32243 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTX2P32243 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTX2P32243 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTX2P32243 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTX2P32243 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
OTX2P32243 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTX2P32243 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTX2P32243 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTX2P32243 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTX2P32243 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTX2P32243 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTX2P32243 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTX2P32243 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTX2P32243 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTX2P32243 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OTX2P32243 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OTX2P32243 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
OTX2P32243 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OTX2P32243 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OTX2P32243 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTX2P32243 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTX2P32243 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTX2P32243 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTX2P32243 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
OTX2P32243 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTX2P32243 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTX2P32243 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTX2P32243 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTX2P32243 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTX2P32243 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTX2P32243 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTX2P32243 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTX2P32243 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTX2P32243 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTX2P32243 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX2P32243 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX2P32243 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX2P32243 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX2P32243 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX2P32243 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX2P32243 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX2P32243 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX2P32243 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX2P32243 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX2P32243 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX2P32243 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX2P32243 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX2P32243 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX2P32243 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX2P32243 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTX2P32243 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms