Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLIP1P30622 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CLIP1P30622 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms