Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD38P28907 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD38P28907 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD38P28907 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD38P28907 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD38P28907 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD38P28907 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD38P28907 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD38P28907 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD38P28907 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD38P28907 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD38P28907 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD38P28907 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD38P28907 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD38P28907 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD38P28907 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CD38P28907 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD38P28907 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD38P28907 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD38P28907 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD38P28907 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD38P28907 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD38P28907 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD38P28907 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD38P28907 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CD38P28907 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD38P28907 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD38P28907 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD38P28907 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD38P28907 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD38P28907 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD38P28907 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD38P28907 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD38P28907 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD38P28907 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD38P28907 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD38P28907 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD38P28907 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD38P28907 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD38P28907 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD38P28907 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD38P28907 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD38P28907 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD38P28907 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD38P28907 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD38P28907 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD38P28907 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD38P28907 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD38P28907 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD38P28907 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD38P28907 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms