Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD1P28340 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD1P28340 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD1P28340 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD1P28340 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD1P28340 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD1P28340 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD1P28340 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD1P28340 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD1P28340 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLD1P28340 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLD1P28340 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLD1P28340 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLD1P28340 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLD1P28340 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLD1P28340 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLD1P28340 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLD1P28340 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLD1P28340 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLD1P28340 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLD1P28340 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLD1P28340 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLD1P28340 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLD1P28340 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLD1P28340 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLD1P28340 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLD1P28340 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLD1P28340 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLD1P28340 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLD1P28340 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLD1P28340 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLD1P28340 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLD1P28340 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLD1P28340 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD1P28340 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD1P28340 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD1P28340 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD1P28340 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD1P28340 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD1P28340 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD1P28340 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD1P28340 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD1P28340 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD1P28340 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD1P28340 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD1P28340 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
POLD1P28340 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD1P28340 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD1P28340 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD1P28340 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD1P28340 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD1P28340 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD1P28340 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD1P28340 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD1P28340 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD1P28340 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD1P28340 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD1P28340 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD1P28340 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD1P28340 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD1P28340 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLD1P28340 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLD1P28340 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLD1P28340 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLD1P28340 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLD1P28340 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLD1P28340 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLD1P28340 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLD1P28340 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLD1P28340 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD1P28340 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD1P28340 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD1P28340 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD1P28340 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD1P28340 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD1P28340 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD1P28340 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD1P28340 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD1P28340 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD1P28340 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD1P28340 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLD1P28340 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD1P28340 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD1P28340 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD1P28340 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD1P28340 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD1P28340 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD1P28340 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD1P28340 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD1P28340 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD1P28340 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD1P28340 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD1P28340 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD1P28340 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD1P28340 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD1P28340 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD1P28340 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLD1P28340 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD1P28340 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLD1P28340 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms