Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMLP26374 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMLP26374 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMLP26374 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMLP26374 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMLP26374 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMLP26374 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMLP26374 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMLP26374 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMLP26374 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMLP26374 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMLP26374 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMLP26374 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMLP26374 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMLP26374 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMLP26374 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMLP26374 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMLP26374 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMLP26374 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMLP26374 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMLP26374 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMLP26374 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMLP26374 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMLP26374 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMLP26374 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMLP26374 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMLP26374 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMLP26374 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMLP26374 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMLP26374 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMLP26374 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMLP26374 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMLP26374 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMLP26374 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMLP26374 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMLP26374 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMLP26374 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMLP26374 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMLP26374 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMLP26374 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMLP26374 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMLP26374 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
CHMLP26374 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.01■■□□□ 1.6
CHMLP26374 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMLP26374 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMLP26374 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMLP26374 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMLP26374 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMLP26374 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMLP26374 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMLP26374 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMLP26374 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMLP26374 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMLP26374 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMLP26374 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMLP26374 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMLP26374 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMLP26374 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMLP26374 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMLP26374 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms