Protein–RNA interactions for Protein: P25582

SPB1, 27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPB1P25582 PNC1YGL037C 651 nt2.86□□□□□ -1.95
SPB1P25582 RPL27AYHR010W 411 nt2.86□□□□□ -1.95
SPB1P25582 PEX18YHR160C 852 nt2.86□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YBR062CYBR062C 543 nt2.86□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YPR170CYPR170C 336 nt2.86□□□□□ -1.95
SPB1P25582 DSF2YBR007C 2211 nt2.86□□□□□ -1.95
SPB1P25582 ESL1YIL151C 3357 nt2.86□□□□□ -1.95
SPB1P25582 ARK1YNL020C 1917 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YNL193WYNL193W 1677 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 VPS30YPL120W 1674 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 DBF20YPR111W 1695 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 CWC22YGR278W 1734 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 ADY4YLR227C 1482 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 GEA1YJR031C 4227 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 snR5snR5 204 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 TMA20YER007C-A 546 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 RRT13YER066W 558 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YHL005CYHL005C 393 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YIL082WYIL082W 873 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 SRP21YKL122C 504 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 RPS16AYMR143W 432 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YNL235CYNL235C 432 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 NGL1YOL042W 1092 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YOR385WYOR385W 873 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YBR051WYBR051W 351 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 UBX3YDL091C 1368 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 DBP10YDL031W 2988 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 MAL33YBR297W 1407 nt2.85□□□□□ -1.95
SPB1P25582 UTP14YML093W 2700 nt2.84□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YIP5YGL161C 933 nt2.84□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YGR017WYGR017W 894 nt2.84□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.84□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.84□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YAR069CYAR069C 294 nt2.84□□□□□ -1.95
SPB1P25582 PCK1YKR097W 1650 nt2.84□□□□□ -1.95
SPB1P25582 YOL057WYOL057W 2136 nt2.84□□□□□ -1.96
SPB1P25582 VHR1YIL056W 1923 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 BIT61YJL058C 1632 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 SLP1YOR154W 1764 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 OCA6YDR067C 675 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 RSR1YGR152C 819 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 YHR213WYHR213W 597 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 CKA1YIL035C 1119 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 TDA8YAL064C-A 381 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 SDO1YLR022C 753 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 YAR062WYAR062W 597 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 YMR181CYMR181C 465 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 HSP10YOR020C 321 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 RRD2YPL152W 1077 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 CSM4YPL200W 471 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 MUD1YBR119W 897 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 YLR446WYLR446W 1302 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 TFB1YDR311W 1929 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 ECM29YHL030W 5607 nt2.83□□□□□ -1.96
SPB1P25582 TMA64YDR117C 1698 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 FLO11YIR019C 4104 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 SKT5YBL061C 2091 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 snR9snR9 187 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 PPH3YDR075W 927 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 TDA2YER071C 381 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 SFT1YKL006C-A 294 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 YKL222CYKL222C 2118 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 YLR012CYLR012C 300 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 CWC24YLR323C 780 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 RIM9YMR063W 720 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 YAP7YOL028C 738 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 KIN82YCR091W 2163 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 MFB1YDR219C 1398 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 SEN54YPL083C 1404 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 SCY1YGL083W 2415 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 YGR067CYGR067C 2415 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 SAP1YER047C 2694 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 MSB2YGR014W 3921 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 CDC20YGL116W 1833 nt2.82□□□□□ -1.96
SPB1P25582 SIN3YOL004W 4611 nt2.81□□□□□ -1.96
SPB1P25582 ECM21YBL101C 3354 nt2.81□□□□□ -1.96
SPB1P25582 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.81□□□□□ -1.96
SPB1P25582 FAR7YFR008W 666 nt2.81□□□□□ -1.96
SPB1P25582 VMA21YGR105W 234 nt2.81□□□□□ -1.96
SPB1P25582 YJR087WYJR087W 351 nt2.81□□□□□ -1.96
SPB1P25582 APC9YLR102C 798 nt2.81□□□□□ -1.96
SPB1P25582 CSI1YMR025W 888 nt2.81□□□□□ -1.96
SPB1P25582 IRC21YMR073C 606 nt2.81□□□□□ -1.96
SPB1P25582 YMR254CYMR254C 309 nt2.81□□□□□ -1.96
SPB1P25582 UTP15YMR093W 1542 nt2.81□□□□□ -1.96
SPB1P25582 FAA2YER015W 2235 nt2.81□□□□□ -1.96
SPB1P25582 RGC1YPR115W 3252 nt2.8□□□□□ -1.96
SPB1P25582 DUG2YBR281C 2637 nt2.8□□□□□ -1.96
SPB1P25582 SSP1YHR184W 1716 nt2.8□□□□□ -1.96
SPB1P25582 RPN3YER021W 1572 nt2.8□□□□□ -1.96
SPB1P25582 YDR209CYDR209C 414 nt2.8□□□□□ -1.96
SPB1P25582 TIM11YDR322C-A 291 nt2.8□□□□□ -1.96
SPB1P25582 YGR053CYGR053C 852 nt2.8□□□□□ -1.96
SPB1P25582 COG2YGR120C 789 nt2.8□□□□□ -1.96
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