Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4BP23588 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms