Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASTP20810 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASTP20810 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASTP20810 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASTP20810 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASTP20810 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASTP20810 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CASTP20810 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASTP20810 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CASTP20810 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASTP20810 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASTP20810 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASTP20810 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASTP20810 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASTP20810 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASTP20810 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASTP20810 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CASTP20810 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASTP20810 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASTP20810 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASTP20810 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASTP20810 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASTP20810 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASTP20810 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASTP20810 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASTP20810 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASTP20810 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CASTP20810 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASTP20810 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASTP20810 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASTP20810 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CASTP20810 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASTP20810 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASTP20810 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASTP20810 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CASTP20810 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CASTP20810 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASTP20810 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASTP20810 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASTP20810 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASTP20810 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASTP20810 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASTP20810 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASTP20810 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASTP20810 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASTP20810 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASTP20810 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASTP20810 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASTP20810 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASTP20810 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASTP20810 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASTP20810 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASTP20810 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASTP20810 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASTP20810 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASTP20810 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASTP20810 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASTP20810 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASTP20810 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASTP20810 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASTP20810 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASTP20810 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASTP20810 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASTP20810 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASTP20810 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASTP20810 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASTP20810 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASTP20810 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASTP20810 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASTP20810 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASTP20810 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASTP20810 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms