Protein–RNA interactions for Protein: P18077

RPL35A, 60S ribosomal protein L35a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35AP18077 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms