Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7P17544 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7P17544 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7P17544 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7P17544 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7P17544 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7P17544 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7P17544 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7P17544 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7P17544 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7P17544 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7P17544 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7P17544 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7P17544 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7P17544 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7P17544 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7P17544 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7P17544 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7P17544 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7P17544 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7P17544 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7P17544 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7P17544 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7P17544 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7P17544 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7P17544 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7P17544 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7P17544 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7P17544 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7P17544 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7P17544 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7P17544 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7P17544 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7P17544 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7P17544 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7P17544 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7P17544 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7P17544 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7P17544 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7P17544 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7P17544 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7P17544 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7P17544 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7P17544 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7P17544 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF7P17544 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF7P17544 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF7P17544 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF7P17544 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7P17544 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7P17544 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7P17544 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7P17544 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7P17544 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7P17544 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7P17544 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7P17544 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7P17544 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7P17544 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7P17544 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7P17544 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7P17544 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7P17544 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7P17544 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF7P17544 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7P17544 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7P17544 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7P17544 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7P17544 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7P17544 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7P17544 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7P17544 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7P17544 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7P17544 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7P17544 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7P17544 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7P17544 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7P17544 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF7P17544 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms