Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms