Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT13P13646 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT13P13646 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT13P13646 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT13P13646 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT13P13646 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT13P13646 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT13P13646 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT13P13646 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT13P13646 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT13P13646 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT13P13646 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT13P13646 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT13P13646 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT13P13646 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT13P13646 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT13P13646 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT13P13646 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT13P13646 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT13P13646 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT13P13646 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT13P13646 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT13P13646 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT13P13646 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT13P13646 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT13P13646 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT13P13646 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT13P13646 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT13P13646 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT13P13646 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT13P13646 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT13P13646 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT13P13646 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT13P13646 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT13P13646 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT13P13646 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT13P13646 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT13P13646 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT13P13646 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms