Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2AP11388 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOP2AP11388 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2AP11388 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms