Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RARBP10826 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RARBP10826 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RARBP10826 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RARBP10826 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RARBP10826 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RARBP10826 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RARBP10826 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RARBP10826 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RARBP10826 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RARBP10826 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RARBP10826 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RARBP10826 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RARBP10826 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RARBP10826 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RARBP10826 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RARBP10826 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RARBP10826 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARBP10826 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARBP10826 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARBP10826 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARBP10826 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARBP10826 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARBP10826 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARBP10826 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARBP10826 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARBP10826 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARBP10826 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARBP10826 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RARBP10826 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARBP10826 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARBP10826 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARBP10826 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARBP10826 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARBP10826 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARBP10826 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARBP10826 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARBP10826 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARBP10826 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RARBP10826 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARBP10826 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARBP10826 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARBP10826 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARBP10826 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARBP10826 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RARBP10826 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARBP10826 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARBP10826 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARBP10826 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARBP10826 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARBP10826 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARBP10826 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARBP10826 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARBP10826 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARBP10826 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARBP10826 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RARBP10826 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARBP10826 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARBP10826 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARBP10826 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARBP10826 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARBP10826 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARBP10826 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RARBP10826 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARBP10826 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARBP10826 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARBP10826 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARBP10826 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARBP10826 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARBP10826 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARBP10826 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARBP10826 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARBP10826 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARBP10826 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARBP10826 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARBP10826 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RARBP10826 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARBP10826 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARBP10826 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARBP10826 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARBP10826 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARBP10826 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RARBP10826 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RARBP10826 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARBP10826 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARBP10826 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARBP10826 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RARBP10826 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARBP10826 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARBP10826 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARBP10826 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RARBP10826 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RARBP10826 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARBP10826 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARBP10826 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARBP10826 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARBP10826 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARBP10826 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARBP10826 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARBP10826 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms