Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GLI4P10075 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GLI4P10075 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GLI4P10075 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GLI4P10075 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GLI4P10075 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GLI4P10075 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GLI4P10075 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GLI4P10075 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GLI4P10075 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GLI4P10075 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GLI4P10075 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GLI4P10075 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GLI4P10075 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GLI4P10075 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GLI4P10075 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GLI4P10075 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GLI4P10075 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GLI4P10075 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GLI4P10075 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GLI4P10075 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GLI4P10075 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GLI4P10075 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GLI4P10075 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GLI4P10075 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GLI4P10075 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GLI4P10075 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GLI4P10075 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GLI4P10075 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GLI4P10075 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI4P10075 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI4P10075 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI4P10075 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI4P10075 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI4P10075 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI4P10075 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI4P10075 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI4P10075 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI4P10075 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI4P10075 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI4P10075 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI4P10075 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI4P10075 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI4P10075 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI4P10075 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI4P10075 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI4P10075 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI4P10075 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI4P10075 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI4P10075 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI4P10075 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI4P10075 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI4P10075 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI4P10075 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI4P10075 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI4P10075 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI4P10075 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI4P10075 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms