Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GLI3P10071 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GLI3P10071 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GLI3P10071 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GLI3P10071 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GLI3P10071 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GLI3P10071 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GLI3P10071 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GLI3P10071 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GLI3P10071 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GLI3P10071 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GLI3P10071 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GLI3P10071 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GLI3P10071 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GLI3P10071 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GLI3P10071 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GLI3P10071 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GLI3P10071 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GLI3P10071 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GLI3P10071 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GLI3P10071 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GLI3P10071 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GLI3P10071 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GLI3P10071 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GLI3P10071 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GLI3P10071 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GLI3P10071 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GLI3P10071 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GLI3P10071 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GLI3P10071 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GLI3P10071 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GLI3P10071 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
GLI3P10071 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GLI3P10071 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GLI3P10071 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GLI3P10071 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GLI3P10071 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
GLI3P10071 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GLI3P10071 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GLI3P10071 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GLI3P10071 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GLI3P10071 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI3P10071 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI3P10071 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI3P10071 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI3P10071 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI3P10071 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI3P10071 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI3P10071 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI3P10071 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI3P10071 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI3P10071 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI3P10071 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI3P10071 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI3P10071 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI3P10071 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI3P10071 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI3P10071 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI3P10071 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI3P10071 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI3P10071 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI3P10071 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI3P10071 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI3P10071 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI3P10071 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI3P10071 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI3P10071 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI3P10071 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI3P10071 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI3P10071 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI3P10071 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLI3P10071 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLI3P10071 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLI3P10071 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLI3P10071 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI3P10071 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI3P10071 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI3P10071 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI3P10071 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI3P10071 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms