Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX58O95786 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX58O95786 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX58O95786 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX58O95786 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX58O95786 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX58O95786 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX58O95786 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX58O95786 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX58O95786 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX58O95786 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX58O95786 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX58O95786 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX58O95786 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX58O95786 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX58O95786 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX58O95786 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX58O95786 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX58O95786 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX58O95786 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX58O95786 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX58O95786 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX58O95786 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX58O95786 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX58O95786 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX58O95786 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX58O95786 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX58O95786 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX58O95786 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX58O95786 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX58O95786 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX58O95786 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX58O95786 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX58O95786 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX58O95786 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX58O95786 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX58O95786 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX58O95786 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX58O95786 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX58O95786 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX58O95786 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX58O95786 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX58O95786 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX58O95786 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX58O95786 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX58O95786 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX58O95786 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX58O95786 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX58O95786 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDX58O95786 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DDX58O95786 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DDX58O95786 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX58O95786 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX58O95786 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX58O95786 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX58O95786 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX58O95786 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX58O95786 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX58O95786 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX58O95786 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDX58O95786 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms