Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

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Length 1,318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP19O94966 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP19O94966 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
USP19O94966 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP19O94966 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP19O94966 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP19O94966 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP19O94966 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP19O94966 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP19O94966 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USP19O94966 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USP19O94966 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP19O94966 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP19O94966 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP19O94966 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP19O94966 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USP19O94966 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP19O94966 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP19O94966 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP19O94966 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP19O94966 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP19O94966 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP19O94966 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP19O94966 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP19O94966 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USP19O94966 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP19O94966 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP19O94966 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP19O94966 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP19O94966 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP19O94966 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP19O94966 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP19O94966 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP19O94966 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP19O94966 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP19O94966 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP19O94966 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP19O94966 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP19O94966 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP19O94966 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP19O94966 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP19O94966 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP19O94966 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP19O94966 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
USP19O94966 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP19O94966 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP19O94966 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP19O94966 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP19O94966 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP19O94966 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP19O94966 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
USP19O94966 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP19O94966 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
USP19O94966 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP19O94966 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP19O94966 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP19O94966 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP19O94966 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP19O94966 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP19O94966 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP19O94966 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP19O94966 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP19O94966 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP19O94966 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP19O94966 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP19O94966 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP19O94966 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP19O94966 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP19O94966 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP19O94966 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP19O94966 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP19O94966 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP19O94966 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP19O94966 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP19O94966 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP19O94966 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP19O94966 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP19O94966 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP19O94966 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP19O94966 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
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