Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM2O94769 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM2O94769 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM2O94769 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM2O94769 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM2O94769 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM2O94769 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM2O94769 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM2O94769 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM2O94769 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM2O94769 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM2O94769 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM2O94769 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM2O94769 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM2O94769 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM2O94769 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM2O94769 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM2O94769 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM2O94769 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM2O94769 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM2O94769 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM2O94769 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM2O94769 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM2O94769 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM2O94769 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM2O94769 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM2O94769 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM2O94769 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM2O94769 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM2O94769 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM2O94769 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM2O94769 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM2O94769 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM2O94769 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM2O94769 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM2O94769 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM2O94769 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM2O94769 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM2O94769 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM2O94769 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM2O94769 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM2O94769 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM2O94769 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM2O94769 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM2O94769 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM2O94769 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM2O94769 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM2O94769 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM2O94769 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM2O94769 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM2O94769 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM2O94769 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECM2O94769 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECM2O94769 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECM2O94769 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECM2O94769 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM2O94769 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM2O94769 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM2O94769 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM2O94769 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM2O94769 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM2O94769 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM2O94769 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM2O94769 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM2O94769 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM2O94769 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM2O94769 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM2O94769 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM2O94769 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM2O94769 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM2O94769 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM2O94769 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM2O94769 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM2O94769 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECM2O94769 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM2O94769 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM2O94769 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM2O94769 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM2O94769 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM2O94769 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECM2O94769 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms