Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR5O75473 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR5O75473 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR5O75473 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR5O75473 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR5O75473 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR5O75473 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR5O75473 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR5O75473 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR5O75473 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR5O75473 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR5O75473 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR5O75473 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR5O75473 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR5O75473 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR5O75473 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR5O75473 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR5O75473 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR5O75473 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR5O75473 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR5O75473 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR5O75473 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR5O75473 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR5O75473 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR5O75473 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR5O75473 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR5O75473 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR5O75473 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR5O75473 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR5O75473 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR5O75473 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR5O75473 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR5O75473 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR5O75473 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR5O75473 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR5O75473 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR5O75473 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR5O75473 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR5O75473 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR5O75473 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR5O75473 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR5O75473 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR5O75473 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR5O75473 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR5O75473 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR5O75473 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR5O75473 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR5O75473 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR5O75473 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR5O75473 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR5O75473 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR5O75473 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR5O75473 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR5O75473 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR5O75473 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR5O75473 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR5O75473 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR5O75473 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR5O75473 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR5O75473 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR5O75473 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LGR5O75473 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LGR5O75473 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LGR5O75473 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LGR5O75473 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LGR5O75473 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LGR5O75473 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LGR5O75473 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms