Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL3O43909 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL3O43909 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms