Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNAB3O43448 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms