Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIMBP2O15034 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIMBP2O15034 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms