Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARVCFO00192 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms