Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVV-2B6SEH9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-2B6SEH9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVV-2B6SEH9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms