Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEURL1BA8MQ27 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEURL1BA8MQ27 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms