Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCCD1A6NED2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms