Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6BA6NDN3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms