Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FARSAQ9Y285 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FARSAQ9Y285 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms