Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE0

EDAR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDARQ9UNE0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDARQ9UNE0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EDARQ9UNE0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EDARQ9UNE0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDARQ9UNE0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDARQ9UNE0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDARQ9UNE0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDARQ9UNE0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDARQ9UNE0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDARQ9UNE0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDARQ9UNE0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDARQ9UNE0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDARQ9UNE0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms