Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH7Q9ULB5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH7Q9ULB5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH7Q9ULB5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms