Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AMFRQ9UKV5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms