Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms