Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF1Q9UBU9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms