Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMCD1Q9NZU5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMCD1Q9NZU5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms