Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASF1BQ9NVP2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms