Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN3Q9NT22 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms