Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOMER2Q9NSB8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOMER2Q9NSB8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms