Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC86Q9H6F5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms