Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EHD4Q9H223 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EHD4Q9H223 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms