Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR1EQ9GZS1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms