Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A8Q9C0K1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A8Q9C0K1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms