Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAIPQ9BWF2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAIPQ9BWF2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms