Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRACR2AQ9BSW2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms