Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RTKNQ9BST9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms