Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms